Functional exploration of in vivo and in vitro lignocellulose-fed rumen bacterial microbiomes reveals novel enzymes involved in polysaccharide breakdown
Archive ouverte
| Ufarte, Lisa | CCSD
BioRxiv.
Background: Plant cell walls are the main carbon sources for ruminal bacteria, which have evolved to produce sophisticated multi-functional enzyme cocktails in response to the structural diversity of lignoc...
Highly promiscuous oxidases discovered in the bovine rumen microbiome
Archive ouverte
| Ufarté, Lisa | CCSD
The bovine rumen hosts a diverse microbiota, which is highly specialized in the degradation of lignocellulose. Ruminal bacteria, in particular, are well equipped to deconstruct plant cell wall polysaccharides. Nevertheless, their ...
Functional metagenomics: construction and high-throughput screening of fosmid libraries for discovery of novel carbohydrate-active enzymes
Archive ouverte
| Ufarté, Lisa | CCSD
Activity-based metagenomics is one of the most efficient approaches to boost the discovery of novel biocatalysts from the huge reservoir of uncultivated bacteria. In this chapter, we describe a highly generic procedure of metageno...
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