0 avis
Mise au point d’outils pour l’étude protéomique de la protéine ORF3 du virus de la diarrhée épidémique porcine
Archive ouverte
Edité par CCSD -
International audience. L’épidémie de SARS-CoV-2, troisième émergence à coronavirus chez l’humain ces 20 dernières années, a dramatiquement remis en lumière l’importance du potentiel zoonotique des Coronaviridae. Répartis en 4 genres, Alpha, Beta, Delta et Gamma, les deux premiers sont retrouvés parmi les mammifères, et les deux derniers essentiellement chez les volailles. Les coronavirus partagent une organisation génomique commune, avec les deux premiers tiers du génome codant le complexe de réplication, suivis par les séquences codant les protéines structurales. Suivant les genres, une ou plusieurs séquences codant des protéines dites accessoires sont intercalées entre les gènes structuraux. À l’exception des Deltacoronavirus, au moins une ORF accessoire est nichée entre les gènes Spicule et Enveloppe. Le produit de l’une de ces ORF, située entre les séquences codantes des protéine S et E, majoritairement nommée ORF3 et présente chez les Alpha et une majorité de Betacoronavirus, serait directement impliqué dans la virulence et la régulation du cycle infectieux. La protéine codée par l’ORF3 est essentiellement caractérisée chez les betacoronavirus SARS-CoV-1 et 2. Afin d’étendre nos connaissances sur ces protéines accessoires, nos travaux portent sur la protéine ORF3 de l’alphacoronavirus de la diarrhée épidémique porcine (PEDV). Notre équipe développe les outils moléculaires adéquats pour la recherche de ses partenaires protéiques, ainsi qu’un protocole d’infection sur organoïdes intestinaux de porcs, modèle cellulaire plus représentatif des conditions réelles d’infection que la culture sur cellule Vero. La recherche et l’identification des interactants seront réalisées parspectrométrie de masse, grâce à un système d’expression et de co-immunoprécipitation de la protéine d’intérêt. Un outil de génétique inverse, en cours de finalisation, permettra de valider nos résultats dans un contexte infectieux, et d’étendre la caractérisation de cette protéine à des souches difficilement cultivables.
Consulter en ligne
Suggestions
Du même auteur
