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PCR DermaGenius (Pathonostics) sur ELITe InGenius (ELITechGroup) : une association géniale ?
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Edité par CCSD -
International audience. Objectif – IntroductionL’intérêt des techniques de biologie moléculaire pour le diagnostic des infections fongiques superficielles a récemment été démontré. La technique DermaGenius 2.0 (Pathonostics) permet la détection de 13 espèces de dermatophytes et 1 espèce de levure responsables d’infections fongiques superficielles. Elle a récemment été adaptée sur l’automate de biologie moléculaire ELITe InGenius (ELITechGroup), intégrant les étapes d’extraction et d’amplification des acides nucléiques. Cette étude visait à évaluer les performances de l’association DermaGenius – InGenius pour le diagnostic des dermatophytoses par rapport aux techniques conventionnelles.Matériels (ou Patients) et méthodesCinquante-quatre prélèvements (29 ongles, 12 prélèvements cutanés, 9 prélèvements du cuir chevelu et 4 cultures de dermatophytes (espèces rares)) ont été analysés. Les échantillons ont été préalablement incubés une nuit à 37°C dans 500 µL de tampon ATL (Qiagen) avant extraction et PCR avec le kit DermaGenius 2.0 sur l’automate ELITe InGenius.Les performances de l’association DermaGenius - InGenius ont été comparées au diagnostic établi par les techniques conventionnelles : examen direct, culture +/- identification d’espèce sur les aspects macro- et microscopiques des colonies et par MALDI-TOF (base MSI2).RésultatsL’association DermaGenius – InGenius a démontré d’excellentes sensibilité (87%) et spécificité (100%) pour le diagnostic des infections fongiques superficielles, ainsi qu’une bonne concordance avec les techniques conventionnelles : pourcentage de concordance : 91%, coefficient kappa de Cohen : 0,78. Par ailleurs, elle permet une identification d’espèce en <24h (en tenant compte du pré-traitement) contre 8 jours en médiane pour les techniques conventionnelles.ConclusionCette étude confirme les très bonnes performances du kit DermaGenius 2.0 pour le diagnostic des dermatophytoses. Son utilisation sur la plateforme ELITe InGenius est simple et permet de réduire significativement le délai de rendu des résultats : ceci est particulièrement intéressant pour le diagnostic des espèces impliquées dans les teignes du cuir chevelu pour instaurer au plus vite un traitement et des mesures de prévention de la transmission. Son positionnement exact dans la démarche diagnostique des dematophytoses reste toutefois à affiner.
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