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Projet ReproVIP. Projet ReproVIP: Vers des Résultats Reproductibles en Imagerie Médicale
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Edité par CCSD -
International audience. VIP (Virtual Imaging Platform)1 est une plateforme de calcul pour l'analyse de donnée en imagerie médicale. Elle propose aux chercheurs du domaine l’exécution d’applications scientifiques en tant que service, avec la performance d’un système de calcul distribué. Elle exploite pour cela les ressources de l’e-infrastructure EGI2.En tant que fournisseur d’applications, VIP est concernée par la crise de reproductibilité qui touche la recherche en imagerie médicale : d’un essai à l’autre, la réexécution d’un même traitement sur les mêmes données ne garantit pas la production des mêmes résultats. Lorsqu’on peut reproduire à l’identique (i) le logiciel d’analyse et (ii) le procédé d’exploration des données (modèles, pipelines), c’est (iii) l’environnement de calcul (ex. : OS, composants) qui s’impose comme source de variabilité supplémentaire et difficile à contrôler3. En tant que plateforme de calcul aux environnements multiples, VIP offre un terrain d’expérimentation favorable pour quantifier et corriger cette incertitude numérique sur les résultats scientifiques.Le projet ANR ReproVIP (ANR-21-CE45-0024-01) aborde la crise de reproductibilité à tous les niveaux d'analyse, depuis l'environnement de calcul jusqu’au processus de traitement des données médicales. Il inclut deux objectifs complémentaires : (i) évaluer l'incertitude des résultats obtenus sur la plateforme VIP et (ii) améliorer leur reproductibilité, de manière transparente pour l’utilisateur. Dans cette présentation, on s’intéressera notamment aux méthodes d’évaluation de l’incertitude en sortie d’un pipeline d’analyse de données d’IRM.
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