Exploration du génome du peuplier noir : identification de variations structurales

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Guilbaud, Romane | Jorge, Véronique | Rogier, Odile | Sanchez Rodriguez, Leopoldo | Faivre-Rampant, Patricia | Duruflé, Harold

Edité par CCSD -

International audience. Exploration du génome du peuplier noir: identification de variations structurales Les variations structurales (SVs) sont des réarrangements génomiques de plus de 50 pb, incluant les insertions, délétions, duplications et inversions. Ces variations sont très étudiées chez de nombreuses espèces car elles sont en lien avec certaines maladies ou la variation de caractères d'intérêt. Avec l'accessibilité du reséquençage pour de nombreuses espèces végétales, dont les arbres, de plus en plus d'études sur les SVs sont réalisées et rendent accessibles de nombreux outils bioinformatiques pour leur détection. L'objectif premier de cette étude est d'établir un catalogue de SVs chez le peuplier noir, Populus nigra, en exploitant l'information apportée par notre matériel structuré en trios.

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