Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seq

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Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seq

Archive ouverte

Imbert, Alyssa | Villa-Vialaneix, Nathalie, N.

Edité par CCSD -

National audience. Dans cette proposition de communication, nous présentons les packages R qui permettent d'analyser et de simuler des données issues des technologies de séquençage du transcriptome (RNAseq). Dans un premier temps, nous ferons un tour rapide des packages qui permettent d'e ectuer la normalisation et l'analyse di érentielle. Puis, nous discuterons des méthodes pour inférer un réseau de gènes à partir de telles données et les packages R associés. En n, nous présenterons quels packages permettent de simuler des réseaux et des données transcriptomiques à partir de ces réseaux.

Langue: Français

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