Consensus LASSO : inférence conjointe de réseaux de gènes dans des conditions expérimentales multiples

Archive ouverte

Villa-Vialaneix, Nathalie | San Cristobal, Magali

Edité par CCSD -

National audience. Nous présentons ici une méthode pour l'inférence de réseaux de co-expression génique à partir de données d'expression obtenues dans des conditions expérimentales différentes. Cette approche est basée sur une double pénalité, permettant d'une part l'obtention d'une solution parcimonieuse et, d'autre part, la proximité entre les divers réseaux inférés dans les diverses conditions et un réseau consensus commun à toutes les conditions.

Suggestions

Du même auteur

Inferring networks from multiple samples with Consensus LASSO

Archive ouverte | Villa-Vialaneix, Nathalie | CCSD

International audience. Networks are very useful tools to decipher complex regulatory relationships between genes in an organism. Most work address this issue in the context of i.i.d., treated vs. control or time-se...

Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference

Archive ouverte | Villa-Vialaneix, Nathalie | CCSD

Nous privilégions l'oral comme type de communication mais si cela n'était pas possible, notre deuxième voeu serait le lightning talk. "Chantier qualité spécifique "Auteurs Externes" département de Génétique animale : uniquement li...

The structure of a gene network reveals 7 biological sub-graphs underlying eQTLs in pig

Archive ouverte | Liaubet, Laurence | CCSD

International audience. Integrative and system biology is a very promising tool for deciphering the biological and genetic mechanisms underlying complex traits. Transcriptomic analyses, in combination with genomic p...

Chargement des enrichissements...