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L’échelle atomique comme support pour la biologie : Biochimie et biophysique des protéines (dés)ordonnées par RMN in vitro et en cellules
Archive ouverte
Edité par CCSD -
Ce manuscrit présente les éléments factuels de mon cursus et de mes activités de recherche, puis décrit mes travaux de recherche passés et présents ; j’y propose aussi mes réflexions sur les suites à leur donner. Cette présentation est chronologique, et donne pour chaque période un panorama des connaissances antérieures aux projets pour comprendre leur contexte, puis montre leur intégration dans les développements postérieurs. Mes activités se sont construites autour de la spectroscopie RMN et des questions qu’elle pouvait renseigner spécifiquement. Je me suis intéressé successivement à l’analyse conformationnelle des polysaccharides bactériens et leur reconnaissance par le système immunitaire (thèse), puis à l’analyse conformationnelle et biochimique des protéines désordonnées in vitro et in-cell (post-doctorat et CR-CNRS), que j’étends aux protéines multidomaines contenant des régions désordonnées et aux kinases (CR-CNRS).Les lecteurs trouveront de nombreuses informations sur le travail de production recombinante et purification de protéines (en bactérie, « cell-free » et cellules d’insecte et mammifères ; p53, Mdm2, Elk1, Oct4, Sox2, Esrrb, a-synucléine, …, nombreuses kinases), et d’améliorations de sensibilité pour la spectroscopie RMN (séquences d’impulsions, marquages isotopiques innovants). Les méthodes développées visent à permettre la compréhension : i) de la signalisation cellulaire transmise par les protéines désordonnées et leurs sites de modifications post-traductionnelles multiples ; ii) du comportement structural et des interactions des protéines en cellule. Ils ont trouvé des applications dans l’étude de mécanismes moléculaires liés aux cancers et aux maladies neurodégénératives.Je décris enfin les avancées récentes de la communauté et leur impact sur les orientations à donner à mes activités.
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