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Identification d'un motif de six adénines dans l'hémagglutinine des virus influenza aviaires, de sous-type H5, comme déterminant essentiel pour l'acquisition d'un site de clivage multi-basique
Archive ouverte
Edité par CCSD -
International audience. Les virus influenza représentent une menace pour la santé animale et humaine en raison de leur forte variabilité génétique et de leur caractère zoonotique. Chez les oiseaux, les virus de sous types H5 et H7 peuvent évoluer vers des formes hautement pathogènes, capable de se répliquer de manière systémique. Cette évolution se caractérise par l’acquisition d’un site de clivage multibasique (MBCS) dans l’hémagglutinine (HA). Le mécanisme génétique conduisant à l’apparition de ce MBCS est encore mal caractérisé. Nous nous sommes demandé si tous les virus H5Nx faiblement pathogènes avaient le même potentiel évolutif et s’il existait des caractéristiques spécifiques du segment HA qui pourraient influencer l’évolution vers la forme hautement pathogène. Nous avons développé un système de génétique inverse qui génère des virus influenza contenant des séquences HA entières sous forme de transgène à la _n du segment codant la protéine PA. Dans ce modèle, le virus a donc deux gènes codant HA : une sous-forme de transgène qui ne sera jamais exprimé,afin qu’aucune pression de sélection ne soit exercée sur sa fonction protéique, et un autre, correspondant au segment HA sauvage, qui sera quant à lui classiquement exprimé. L’accumulation de mutations sur le transgène HA est donc étudiée en fonction de la séquence nucléotidique uniquement. Nous avons réussi à produire et caractériser des virus infectieux contenant le transgène HA. Nous avons testé comment différents environnements nucléotidiques pouvaient influencer les erreurs de polymérase virale en utilisant ce système et du séquençage haut débit. Nous avons identifié un motif nucléotidique minimal constitué d’une séquence de six adénines consécutives, qui pourrait favoriser les événements d’insertion de nucléotides, une étape critique dans l’acquisition du MBCS et l’émergence des virus hautement pathogènes. Ces résultats fournissent de nouvelles informations sur les mécanismes impliqués dans le passage des formes faiblement pathogènes vers les hautement pathogènes.
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