Automatising 13 C-fluxomics flux calculations through a workflow hosted on the Workflow4Metabolomics Galaxy platform. Automatisation de workflows computationnels de 13C-fluxomique hébérgés sur l'instance Galaxy Workflows4Metabolomics
An automated workflow for high-throughput 13C-fluxomics
Archive ouverte
| Le Grégam, Loïc | CCSD
International audience.
The goal of isotope-based fluxomics approaches is to quantify metabolic fluxes in living organisms. 13C-fluxomics provides a detailed phenotypic description of the actual metabolic state of s...
IsoDesign: substrate design for isotopic labelling experiments
Archive ouverte
| Le Grégam, Loïc | CCSD
International audience.
In systems biology, studying the functioning of the intricate network of biochemical reactions governing cellular metabolism is crucial for elucidating the behaviour of living organisms. Meta...
PhysioFit: a software to quantify cell growth parameters and extracellular fluxes
Archive ouverte
| Le Grégam, Loïc | CCSD
International audience.
Abstract Summary Quantification of growth parameters and extracellular uptake and production fluxes is central in systems and synthetic biology. Fluxes can be estimated using various mathemat...
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