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Déterminisme génétique de la composition protéique des graines de légumineuses et de sa plasticité vis-à-vis de l’environnement
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Edité par CCSD -
Prod 2018-102e BAP GEAPSI DOCT INRA. National audience. Les légumineuses sont capables de produire des graines riches en protéines sans apport d’engrais azoté grâce à la symbiose racinaire avec des bactéries du genre rhizobium. Riches en lysine, ces protéines sont utilisées pour l’alimentation des animaux d’élevage et en nutrition humaine. Afin de promouvoir la culture des légumineuses, il est nécessaire d’optimiser et de stabiliser la qualité de cette fraction protéique. L’objectif de ma thèse est de mettre en évidence les déterminismes génétiques sous-jacents à la teneur et à la composition protéique des graines de légumineuses ainsi qu’à la plasticité de ces composantes vis-à-vis de l’environnement. Afin de répondre à cet objectif, l’approche choisie est en deux volets connectés, l’un utilisant l’espèce modèle Medicago truncatula comme tremplin pour l’identification de gènes candidats et l’autre se focalisant directement sur le pois. La méthode combine un protéotypage des graines de collections d’écotypes produites dans différentes conditions environnementales. A partir des données de protéotypage, une étude de génétique d’association à l’échelle du génome (GWAS) sera effectuée. Les modules de régulation géniques impliquant les gènes identifiés par GWAS seront mis en évidence en utilisant les ressources transcriptomiques associées au développement de la graine de M. truncatula. En utilisant la synténie avec le pois, nous rechercherons les orthologues des gènes candidats chez cette espèce cible. Cette approche permettra d’identifier des gènes candidats pour le contrôle de la composition protéique ainsi que de sa plasticité vis-à-vis de l’environnement chez le pois.
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