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A genetic analysis of variable number of tandem repeats (VNTR) polymorphism in the horse. Analyse génétique du polymorphisme du nombre variable de répétitions en tandem (VNTR) chez le cheval.
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Edité par CCSD ; BioMed Central -
International audience. Restriction fragment length polymorphism detected with the 33.6 minisatellite probe (Jeffreys et al, 1985) was analysed in 3 horse families of paternal half-sibs and in a sample of stallions from 4 breeds. Among the bands detected on Hae III genomic DNA digests, it was found that strongly hybridizing fragments behaved as alleles at 2 different loci. These 2 loci, showing 7 and 3 detectable alleles, were not closely linked to each other nor to informative blood groups and protein markers. No neo-mutation in allele length was observed at these 2 loci ip the 3 families. In the stallion sample, 8 alleles were detected at the first locus and no differences were found between their frequencies in the 4 breeds. Heterozygosity and polymorphism information content (PIC) values estimated in the 4 breeds show that the Thoroughbred is the least variable breed and the Arab the most. In the whole population the PIC values were 0.73 and 0.70 respectively. . Le polymorphisme de longueur de fragment de restriction détecté par la sonde minisatellite 33.6 (Jeffreys et al, 1985) a été analysé chez le cheval dans trois familles de demi-germains paternels et dans un échantillon d’étalons de quatre races. Parmi toutes les bandes révélées à partir d’ADN génomique digéré par Hae III, les fragments donnant un signal intense se comportent comme des allèles ségrégeant à deux locus différents. Ceux-ci, qui possèdent respectivement sept et trois allèles détectables, ne sont pas étroitement liés entre eux ni avec les locus informatifs des groupes sanguins et des protéines du sang. Aucune néo-mutation de longueur des allèles n’a été détectée dans les trois familles. Dans l’échantillon des étalons, huit allèles ont été observés au premier locus et aucune différence de fréquence n’apparaît entre les quatre races. Les valeurs d’hétérozygotie et les valeurs informatives des polymorphismes (PIC) estimées sur cet échantillon montrent que la race de Pur-sang est la moins variable à l’opposé de la race Arabe. Les valeurs estimées sur la population totale sont respectivement de 0,73 et de 0, 70.