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Near Infrared Spectroscopy used as a support to the diagnostic of Fusarium species. Utilisation de la spectroscopie proche infrarouge en tant qu’aide au diagnostic d’espèces de Fusarium. Near Infrared Spectroscopy used as a support to the diagnostic of Fusarium species: Utilisation de la spectroscopie proche infrarouge en tant qu’aide au diagnostic d’espèces de Fusarium
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Edité par CCSD ; Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse -
International audience. La contamination fongique est un des principaux risques sanitaires pour l'industrie des céréales, car des moisissures pathogènes peuvent produire des métabolites secondaires toxiques, les mycotoxines. L'objectif de cette étude est d’appliquer la spectroscopie proche infrarouge pour identifier et discriminer des Fusarium, cultivés sur un milieu de culture solide, et ce, sans préparation de l'échantillon. Cette approche doit permettre la discrimination des espèces de Fusarium les plus abondantes sur maïs: Fusarium graminearum, Fusarium proliferatum, Fusarium subglutinans et Fusarium verticillioides. Les spectres infrarouges de 58 souches de Fusarium appartenant à ces quatre espèces, cultivées sur des médias solides, ont été collectés sur un spectromètre FOSS NIRSystem 6500, en réflectance, avec plusieurs répétitions. La dimension des spectres infrarouges a été réduite en appliquant une analyse en composantes principales (ACP). Les 20 premières composantes principales ont été utilisées dans l'analyse factorielle discriminante (AFD), et en tant que neurones d’entrée dans les réseaux de neurones artificiels. Le modèle AFD a donné de bons résultats pour la discrimination selon l'espèce. La meilleure architecture de réseaux de neurones est [20-35-4]. Avec ce modèle, le taux de classification correcte sur le jeu de validation externe est excellent (98,8 %). La spectroscopie proche infrarouge pourrait de ce fait être utilisée en tant qu’outil d’aide au diagnostic, en association avec le diagnostic morphologique et microscopique, pour le rendre plus rapide et le valider.
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