The OPEP protein model: from single molecules, amyloid formation, crowding and hydrodynamics to DNA/RNA systems
Archive ouverte
| Sterpone, Fabio | CCSD
International audience.
The OPEP coarse-grained protein model has been applied to a wide range of applications since its first release 15 years ago.
Coarse-Grained HiRE-RNA Model for ab Initio RNA Folding beyond Simple Molecules, Including Noncanonical and Multiple Base Pairings
Archive ouverte
| Cragnolini, Tristan | CCSD
International audience.
HiRE-RNA is a coarse-grained model for RNA structure prediction and the dynamical study of RNA folding. Using a reduced set of particles and detailed interactions accounting for base-pairing ...
Coarse-Grained Simulations of RNA and DNA Duplexes
Archive ouverte
| Cragnolini, Tristan | CCSD
International audience
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