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Emergence and spread of a higly pathogenic avian Influenza A (H5N1) Genotype of clade 2.2.4.4.B adapted to laridae in France. Émergence et diffusion d’un génotype de virus d’influenza aviaire hautement pathogène A(H5N1) de clade 2.2.4.4.b adapté aux Laridae en France
Archive ouverte
Edité par CCSD -
International audience. Les virus influenza aviaires (AIV) sont des virus segmentés à ARN à polarité négative. Ils sont classés selon leur type d’hémagglutinine (HA). Depuis 1996, des virus influenza aviaires hautement pathogènes (IAHP) de sous-type H5 de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 (Gs/GD/96) ont provoqué des épidémies récurrentes impliquant de fortes mortalités chez les oiseaux sauvages, mais également chez les oiseaux d’élevage. Depuis quatre ans, l’Europe est confrontée chaque année à une épizootie massive d’IAHP H5 de clade 2.3.3.4b. En Europe, au moins 50 génotypes de virus d’IAHP H5 de clade 2.3.3.4b ont été observés depuis 2021, indiquant de très nombreux événements de réassortiments entre le virus H5 clade 2.3.4.4b et d’autres AIV faiblement pathogènes (FP). Alors que les années précédentes, la plupart des virus IAHP H5 détectés en Europe étaient principalement détectés pendant la période octobre-mars, en 2022, de manière exceptionnelle, de nombreux virus IAHP H5 ont été détectés chez des oiseaux sauvages entre la période avrilseptembre et ont provoqué de fortes mortalités chez les Laridae (goélands, mouettes, sternes). Les analyses phylogénétiques des 8 segments viraux ont indiqué que les virus mis en évidence chez les Laridae appartiennent très majoritairement au même génotype (BB) et que leurs segments génomiques PA, NP et NS sont directement apparentés à des AIV de sous-type H13 (les virus de sous-type H13 étant principalement inféodés aux espèces de Laridae). Les analyses de nombreux génomes de génotype BB, collectés sur un peu plus d’un an, ont permis d’estimer la date et le lieu d’émergence de ce génotype ainsi que de suivre sa diffusion tant au niveau géographique que temporel. Cette diffusion a été marquée par différentes vagues épidémiques entre 2022 et 2023. La première vague était principalement liée aux goélands. La seconde vague impliquait majoritairement des mouettes et finalement la troisième vague impactait des mouettes, goélands et sternes.
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